Luego del Congreso del Pueblo, entre el 28 de setiembre y el 1º de octubre de 1966, se realizó el Congreso de Unificación Sindical.

Esa instancia fue un mojón fundamental en el proceso de construcción de la unidad del movimiento sindical  Desde la última década, varios sindicatos de distintas ramas de la producción fueron realizando acciones de apoyo y  coordinación , dando espacios tanto a la discusión ideológica como a la articulación. En ese congreso se aprobaron tres documentos fundamentales :Declaración de Principios, Programa de Soluciones a la Crisis, y un Estatuto.

Asimismo, el congreso definió los estatutos de la CNT y tomó como base programática las resoluciones del l “Congreso del Pueblo” (agosto de 1965) y ratificó la decisión de llamar a la  huelga general si se concretaba un golpe de Estado. La amenaza de golpe era una posibilidad muy presente en las preocupaciones del movimiento popular, particularmente luego del golpe de estado producido en Brasil (abril 1964)