Bonifacio era oriundo de Durazno, estaba casado, tenía 2 hijos, trabajaba como obrero metalúrgico en la fábrica CINOCA y militaba en el Partido Comunista del Uruguay.
Un operativo de más de veinte efectivos identificados como integrantes de las Fuerzas Conjuntas irrumpieron en su domicilio la madrugada del 16 de diciembre de 1975. Lo detienen y lo llevan a varios centros de tortura.
El día 17 de febrero de 1976 recibió un balazo de pistola de un cabo de guardia, caminaba vendado en una fila de presos incomunicados.
El proyectil le atravesó el cuerpo y quedó incrustada en la espalda de otro detenido Carlos Etchebarne.
Fue trasladado al Hospital Militar donde muere el 27 de febrero, a su familia no se le permitió visitarlo.